A diferença é que agora, com os novos recursos da bioquímica e com o estudo dos radicais livres, se sabe para que e porque, determinados alimentos e formas de preparo são indicadas, e outras não. 

Os radicais livres são substâncias altamente reativas que quando se acumulam no organismo produzem um estresse celular que pode chegar à morte da célula. Na melhor das hipóteses, os radicais livres produzem um desgaste e envelhecimento celular precoce. O excesso de radicais livres ou estresse oxidativo é produzido por condições como intoxicações por metais pesados (poluentes da água, ar e alimentos), tabagismo, alcoolismo, frituras e gordura saturada, estresse, tensão emocional e baixa ingestão de alimentos antioxidantes. Esse estresse oxidativo que é um estresse celular, predispõe o organismo a condições como fadiga crônica, infecções freqüentes e a vários tipos de patologia como câncer, psoríase, artrite, doenças auto-imunes, doenças cardio-circulatórias, etc. 

Os anti-oxidantes são as substâncias que combatem esses radicais e são compostos pelas vitaminas, determinados minerais e aminoácidos e também por algumas enzimas e hormônios que sintetizamos no organismo. Os chamados alimentos anti-oxidantes atuam em 4 níveis diferentes: 1) impedem a formação de radicais livres, 2) impedem a sua "propagação", 3) neutralizam os radicais livres já formados e 4) participam da formação dos anti-oxidantes sintetizados pelo organismo. 

Princípios da culinária ortomolecular: 

1) Comer alimentos ricos em anti-oxidantes 

2) Comer uma parte dos alimentos crus 

3) Cozimento no vapor 

4) Utilizar vegetais sem agrotóxicos 

5) Utilizar cereais integrais 

6) Evitar frituras e margarinas 

7) Evitar carne vermelha, porco ou carne em conserva 

8) Evitar enlatados e conservas artificiais 

9) Evitar açúcar branco 

10) Evitar xantinas (cafeína e similares)